MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 29248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019942	TACC	2	8	36	43	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019942	ATTT	2	8	75	82	25 %	75 %	0 %	0 %	432327927
4	NC_019942	AG	3	6	167	172	50 %	0 %	50 %	0 %	432327927
5	NC_019942	GCC	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327927
6	NC_019942	GAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
7	NC_019942	TGA	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327927
8	NC_019942	TTG	2	6	537	542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327927
9	NC_019942	GCT	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327927
10	NC_019942	TCT	2	6	577	582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327927
11	NC_019942	ATA	2	6	614	619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327927
12	NC_019942	TCT	2	6	649	654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327927
13	NC_019942	AGG	2	6	762	767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
14	NC_019942	GCC	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327927
15	NC_019942	CTG	2	6	848	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327927
16	NC_019942	AG	3	6	874	879	50 %	0 %	50 %	0 %	432327927
17	NC_019942	GGAG	2	8	880	887	25 %	0 %	75 %	0 %	432327927
18	NC_019942	A	6	6	922	927	100 %	0 %	0 %	0 %	432327927
19	NC_019942	GAG	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
20	NC_019942	AGA	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327927
21	NC_019942	AC	3	6	1155	1160	50 %	0 %	0 %	50 %	432327927
22	NC_019942	TTG	2	6	1197	1202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327927
23	NC_019942	GTG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327927
24	NC_019942	A	6	6	1292	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	432327927
25	NC_019942	TC	3	6	1325	1330	0 %	50 %	0 %	50 %	432327928
26	NC_019942	CAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
27	NC_019942	ACA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
28	NC_019942	TAT	2	6	1420	1425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327928
29	NC_019942	TC	3	6	1486	1491	0 %	50 %	0 %	50 %	432327928
30	NC_019942	CAA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
31	NC_019942	CAC	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327928
32	NC_019942	TA	3	6	1840	1845	50 %	50 %	0 %	0 %	432327928
33	NC_019942	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327928
34	NC_019942	TGC	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327928
35	NC_019942	AG	4	8	2049	2056	50 %	0 %	50 %	0 %	432327928
36	NC_019942	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
37	NC_019942	GAAA	2	8	2171	2178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019942	TA	3	6	2182	2187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019942	AATGC	2	10	2188	2197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019942	GA	3	6	2230	2235	50 %	0 %	50 %	0 %	432327929
41	NC_019942	GAT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327929
42	NC_019942	TCG	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327929
43	NC_019942	AAT	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327929
44	NC_019942	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327929
45	NC_019942	GAAAGA	2	12	2583	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327929
46	NC_019942	TTC	2	6	2658	2663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327930
47	NC_019942	T	6	6	2664	2669	0 %	100 %	0 %	0 %	432327930
48	NC_019942	CTTC	2	8	2702	2709	0 %	50 %	0 %	50 %	432327930
49	NC_019942	TTC	2	6	2897	2902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327930
50	NC_019942	AGC	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327930
51	NC_019942	AAT	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
52	NC_019942	CATG	2	8	3049	3056	25 %	25 %	25 %	25 %	432327930
53	NC_019942	GAG	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327930
54	NC_019942	A	7	7	3144	3150	100 %	0 %	0 %	0 %	432327930
55	NC_019942	AT	3	6	3244	3249	50 %	50 %	0 %	0 %	432327930
56	NC_019942	ATA	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
57	NC_019942	T	6	6	3351	3356	0 %	100 %	0 %	0 %	432327930
58	NC_019942	ATA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
59	NC_019942	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327930
60	NC_019942	GAG	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
61	NC_019942	GGA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
62	NC_019942	TGA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327931
63	NC_019942	TAT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327931
64	NC_019942	GCA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327931
65	NC_019942	TGG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327931
66	NC_019942	ACA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327931
67	NC_019942	AT	3	6	4087	4092	50 %	50 %	0 %	0 %	432327931
68	NC_019942	GGAA	2	8	4181	4188	50 %	0 %	50 %	0 %	432327931
69	NC_019942	CAG	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327931
70	NC_019942	AC	3	6	4337	4342	50 %	0 %	0 %	50 %	432327931
71	NC_019942	GGA	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
72	NC_019942	TGA	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327931
73	NC_019942	AAAATC	2	12	4491	4502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	432327932
74	NC_019942	TCC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327932
75	NC_019942	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
76	NC_019942	CTTG	2	8	4691	4698	0 %	50 %	25 %	25 %	432327932
77	NC_019942	GAT	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
78	NC_019942	AG	3	6	4764	4769	50 %	0 %	50 %	0 %	432327932
79	NC_019942	CAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327932
80	NC_019942	AAT	2	6	4844	4849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
81	NC_019942	TAC	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327932
82	NC_019942	GAT	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
83	NC_019942	ATTC	2	8	5020	5027	25 %	50 %	0 %	25 %	432327932
84	NC_019942	TGGA	2	8	5083	5090	25 %	25 %	50 %	0 %	432327932
85	NC_019942	ACC	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327932
86	NC_019942	ACA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
87	NC_019942	AAG	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327932
88	NC_019942	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
89	NC_019942	TCCC	2	8	5338	5345	0 %	25 %	0 %	75 %	432327932
90	NC_019942	AAC	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
91	NC_019942	TGC	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327932
92	NC_019942	ACA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
93	NC_019942	CATG	2	8	5600	5607	25 %	25 %	25 %	25 %	432327932
94	NC_019942	ATA	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
95	NC_019942	AAC	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
96	NC_019942	AGA	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327932
97	NC_019942	AGG	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
98	NC_019942	TGG	2	6	5749	5754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327932
99	NC_019942	GATAA	2	10	5862	5871	60 %	20 %	20 %	0 %	432327932
100	NC_019942	GAT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
101	NC_019942	GGA	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
102	NC_019942	TGT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327932
103	NC_019942	A	6	6	5950	5955	100 %	0 %	0 %	0 %	432327932
104	NC_019942	GA	3	6	5971	5976	50 %	0 %	50 %	0 %	432327932
105	NC_019942	TAC	2	6	5997	6002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327932
106	NC_019942	CATA	2	8	6150	6157	50 %	25 %	0 %	25 %	432327933
107	NC_019942	GA	3	6	6209	6214	50 %	0 %	50 %	0 %	432327933
108	NC_019942	GAA	3	9	6220	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
109	NC_019942	TGGT	2	8	6321	6328	0 %	50 %	50 %	0 %	432327933
110	NC_019942	TAA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327933
111	NC_019942	CAT	2	6	6474	6479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327933
112	NC_019942	AAG	2	6	6488	6493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
113	NC_019942	AG	3	6	6492	6497	50 %	0 %	50 %	0 %	432327933
114	NC_019942	AGG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
115	NC_019942	CT	3	6	6674	6679	0 %	50 %	0 %	50 %	432327933
116	NC_019942	AGG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
117	NC_019942	AAG	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
118	NC_019942	AAC	2	6	6745	6750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327933
119	NC_019942	GGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
120	NC_019942	CTT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327933
121	NC_019942	GGA	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
122	NC_019942	GAGAAG	2	12	6806	6817	50 %	0 %	50 %	0 %	432327933
123	NC_019942	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327933
124	NC_019942	ATA	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327933
125	NC_019942	AGG	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
126	NC_019942	A	6	6	7064	7069	100 %	0 %	0 %	0 %	432327934
127	NC_019942	TCA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327934
128	NC_019942	AG	3	6	7133	7138	50 %	0 %	50 %	0 %	432327934
129	NC_019942	TA	3	6	7212	7217	50 %	50 %	0 %	0 %	432327934
130	NC_019942	A	7	7	7243	7249	100 %	0 %	0 %	0 %	432327934
131	NC_019942	GCA	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327934
132	NC_019942	GA	3	6	7410	7415	50 %	0 %	50 %	0 %	432327934
133	NC_019942	TGCTT	2	10	7416	7425	0 %	60 %	20 %	20 %	432327934
134	NC_019942	ATAG	2	8	7456	7463	50 %	25 %	25 %	0 %	432327934
135	NC_019942	AAT	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327934
136	NC_019942	AG	3	6	7566	7571	50 %	0 %	50 %	0 %	432327934
137	NC_019942	TTC	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327934
138	NC_019942	TTC	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327934
139	NC_019942	AAT	3	9	7635	7643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327934
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141	NC_019942	AGA	2	6	7692	7697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327934
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143	NC_019942	GCTG	2	8	7716	7723	0 %	25 %	50 %	25 %	432327934
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154	NC_019942	GATGA	2	10	8240	8249	40 %	20 %	40 %	0 %	432327935
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156	NC_019942	A	6	6	8330	8335	100 %	0 %	0 %	0 %	432327935
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161	NC_019942	AG	3	6	8670	8675	50 %	0 %	50 %	0 %	432327935
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167	NC_019942	GA	3	6	8994	8999	50 %	0 %	50 %	0 %	432327935
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254	NC_019942	T	6	6	13615	13620	0 %	100 %	0 %	0 %	432327936
255	NC_019942	TTC	2	6	13639	13644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
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258	NC_019942	TGA	3	9	13872	13880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327936
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260	NC_019942	TTC	2	6	13924	13929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
261	NC_019942	ACA	2	6	13933	13938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327936
262	NC_019942	CT	3	6	13966	13971	0 %	50 %	0 %	50 %	432327936
263	NC_019942	ATCA	2	8	13980	13987	50 %	25 %	0 %	25 %	432327936
264	NC_019942	AGA	2	6	13995	14000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327936
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266	NC_019942	AGT	2	6	14019	14024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327936
267	NC_019942	ATCC	2	8	14032	14039	25 %	25 %	0 %	50 %	432327936
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269	NC_019942	TAAA	2	8	14069	14076	75 %	25 %	0 %	0 %	432327936
270	NC_019942	CAC	2	6	14202	14207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
271	NC_019942	ACC	2	6	14234	14239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
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285	NC_019942	A	7	7	14867	14873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019942	TGGCT	2	10	15048	15057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_019942	TGG	2	6	15401	15406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_019942	CTT	2	6	20985	20990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327940
401	NC_019942	T	7	7	20999	21005	0 %	100 %	0 %	0 %	432327940
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404	NC_019942	AATT	2	8	21140	21147	50 %	50 %	0 %	0 %	432327940
405	NC_019942	GTT	2	6	21154	21159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327940
406	NC_019942	CAG	2	6	21252	21257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327940
407	NC_019942	GAA	3	9	21287	21295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327940
408	NC_019942	TCCTC	2	10	21374	21383	0 %	40 %	0 %	60 %	432327940
409	NC_019942	CTC	2	6	21387	21392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327940
410	NC_019942	CCT	2	6	21398	21403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327940
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426	NC_019942	GAT	2	6	22055	22060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_019942	T	6	6	22984	22989	0 %	100 %	0 %	0 %	432327943
454	NC_019942	ATG	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_019942	GAA	2	6	23180	23185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_019942	AGG	2	6	23195	23200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_019942	GAG	2	6	23575	23580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327944
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